Im Zuge der Neuerrichtung des Krankenhaus Wien Nord im 21. Wiener Gemeindebezirk erhielt die S- Bahn Haltestelle Brünner Straße eine komplette Modernisierung und einen barrierefreien Direktzugang zum Krankenhaus.

Die Haltestelle wurde in 2 Bauphasen mit wechselseitigen Gleissperren der ÖBB und unter ständiger Aufrechterhaltung des Bahnbetriebes, dem Kundenverkehr, der B7 sowie der Straßenbahn der Wiener Linien umgebaut, sowie zeitgleich mit den Bauvorhaben Sanierung der B7 (MA28) und Neubau KH Wien Nord (KAV) hergestellt.

Im Zuge der Bauarbeiten wurden die beiden bestehenden Tragwerke (zweifeldrige, in Längsrichtung vorgespannte Trogbrücken) über die B7 Brünner Straße abgetragen und durch ein Bahnsteigtragwerk sowie zwei Gleistragwerke (WIB) ersetzt. Die Randbahnsteige wurden abgetragen, die Dämme verbreitert und die Station um ca. 150 m Richtung Floridsdorf auf die Brücke verlegt und ein 160 m langer Inselbahnsteig hergestellt. Auf der Ost- und Westseite der Brücke entstanden zwei neue Aufnahmegebäude mit Liftanlagen sowie die Neusgestaltung der 4 Vorplätze. Um den neuen Bahnsteig zu befahren wurden die beiden Hauptgleise (Gleis 1+2) verschwenkt, neue Weichen eingebaut und der Unterbau saniert.